2020년 세법개정안 국회 기획재정위원회 의결

< 국세기본법 >

< 소득세법 >

<종합부동산세법>

< 부가가치세법 >

< 개별소비세법 >

< 주세법 및 주류 면허 등에 관한 법률 >

< 국세징수법 >

< 관세법 >

< 조세특례제한법 >

기획재정부 대변인

세종특별자치시 갈매로 477 정부세종청사 4동 moefpr@korea.kr

별첨

정부안 대비 수정내용 상세본

1. 국세기본법

현 행(정부안 없음)

수  정  안

□ 인지세 납부지연 가산세

ㅇ 미납세액의 300%

□ 인지세 납부지연가산세 세율 차등 적용

ㅇ (3개월 이내 납부) 100%

ㅇ (3개월 초과 6개월 이내 납부) 200%

ㅇ (6개월 초과 납부) 300%

현 행(정부안 없음)

수  정  안

□ 간편사업자^*에 대한 가산세 면제

* 국내에 전자적 용역을 공급하는 비거주자·외국법인은 간편사업자등록을 하고 
부가가치세 신고‧납부

ㅇ 부가가치세 무신고가산세 면제

ㅇ 부가가치세 과소신고가산세 면제

ㅇ 부가가치세 납부지연가산세 면제

□ 간편사업자 가산세 면제 폐지

현 행(정부안 없음)

수  정  안

<신 설>

□ 경정청구 처리 지연 시 진행상황 등 통지 의무

ㅇ 경정청구 2개월 이내에 처리가 곤란한 경우 
진행상황 및 불복절차 안내^* 통지

* 경정청구 2개월 이내에 결과통지를 받지 못한 경우 
이의신청·심판청구 등 조세불복 가능

정  부  안

수  정  안

□ 소득세 표본자료 공개 근거 신설

ㅇ (표본자료) 개별 납세자를 직·간접적으로 확인할 수 없도록 비식별화한 소득세 관련 기초자료의 일부를 추출하여 표본 형태로 처리한 자료

* (예) 소득금액, 항목별 소득·세액공제금액(교육비, 의료비 등), 과세표준, 결정세액 등 소득세 신고내역

□ 표본자료 이용자에 대한 비밀유지 의무 및 위반시 제재

ㅇ (비밀유지) 타인에게 제공 또는 누설하거나 목적 외의 용도로 사용 금지

ㅇ (과세정보 보호 조치) 자료 이용자에게 대통령령으로 정하는 과세정보 보호조치 요청 가능

ㅇ (과태료) 비밀유지 의무 위반시 2천만 원 이하 과태료 부과

□ 비밀유지 의무 및 위반시 제재 완화

ㅇ (비밀유지) 목적 외의 용도로 사용 금지

정  부  안

수  정  안

□ 중장기 조세정책운용계획 수립
주기 변경

ㅇ 1년 → 5년

* 필요시 5년 이내 기간에도 재수립 가능

□ 중장기 점검‧평가보고서 신설

ㅇ 작성주기: 1년

* 중장기 조세정책운용계획 수립시에는
중장기 조세정책운용계획에 포함 작성 가능

ㅇ 주요 내용

-  주요 세목별 운용 현황

-  비과세‧감면 운용 현황 

-  중장기 계획의 수정이 필요한 경우 해당 변동사항‧요인

□ 중장기 조세정책운용계획 

수립주기 현행 유지

ㅇ 1년

2. 소득세법

현  행(정부안 없음)

수 정 안

□ 주택자금 소득공제 등^* 적용 대상

* ^❶주택임차자금 소득공제, ^❷장기주택저당차입금 이자 지급액 소득공제, ^❸월세세액공제

ㅇ 근로소득이 있는 거주자로서 
무주택(❷의 경우 1주택자 포함) 세대주

* 세대주가 공제를 받지 않는 경우 세대원 적용

<추 가>

□ 외국인 근로자도 적용대상에 추가

ㅇ (좌 동)

-  무주택(❷의 경우 1주택자 포함) 외국인 근로자^*도 포함

* 구체적인 범위는 시행령 규정

현  행(정부안 없음)

수 정 안

□ 근로소득 간이지급명세서 
제출 불성실 가산세

□ 가산세율 50% 인하

ㅇ (대상) 근로소득간이지급명세서를 
제출하지 않거나 허위 제출하는 경우

ㅇ (좌 동)

ㅇ (가산세) 지급금액 × 0.5%

ㅇ (가산세) 지급금액 × 0.25%

* 기한 후 3개월 이내 제출시 50% 감면

* (좌  동)

3. 법인세법

현  행(정부안 없음)

수 정 안

□ 기부금영수증 정의(법인법 §75의4, 소득법§81의7) 

ㅇ법인세 : 손금산입을 위해 
필요한 영수증

ㅇ소득세 : 필요경비에 산입하거나
세액공제를 위해 필요한 영수증

□ 정의 추가

ㅇ (좌 동)

<추 가>

ㅇ 전자기부금영수증 

-  대통령령^*으로 정하는 전자적 방법으로 발급하는 영수증 포함

* 국세청장이 구축한 전자기부금영수증 발급시스템을 통해 발급하는 영수증

□ 기부자별 발급명세 보관 및 제출 의무(법인법 §112의2, 소득법§160의3) 

ㅇ (보관) 기부금영수증 발급일로부터 5년간

□ 단서 추가

ㅇ (좌 동)

ㅇ (제출) 국세청장 등이 요청시 
제출할 의무

ㅇ (좌 동)

<단서 추가>

ㅇ 전자기부금영수증 발급분

-  발급명세 보관 및 제출 의무 면제

□ 기부금영수증 발급명세서 제출

ㅇ 사업연도 종료일로부터 6개월 이내 관할세무서에 제출

<단서 추가>

ㅇ 전자기부금영수증 발급분

-  제출의무 면제

현  행(정부안 없음)

수 정 안

□ 근로소득 간이지급명세서 
제출 불성실 가산세

□ 가산세율 50% 인하

ㅇ (대상) 근로소득간이지급명세서를 
제출하지 않거나 허위 제출하는 경우

ㅇ (좌 동)

ㅇ (가산세) 지급금액 × 0.5%

ㅇ (가산세) 지급금액 × 0.25%

* 기한 후 3개월 이내 제출시 50% 감면

* (좌  동)

4. 종합부동산세법

현  행(정부안 없음)

수  정  안

<신 설>

□ 부부공동명의 1주택자에 대해 1주택자로
신고 허용

ㅇ 기본공제 : 9억원

ㅇ 고령자 및 장기 보유 공제 적용

5. 부가가치세법

정  부  안

수  정  안

□ 신탁 관련 부가가치세제 개편 

ㅇ 납세의무자를 수탁자 원칙으로 전환

-  (원칙) 수탁자, (예외) 위탁자^*

* 위탁자가 거래 당사자가 되거나, 실질적으로 신탁재산을 통제‧지배하는 경우 등

□ 시행시기 6개월 유예

ㅇ (좌 동)

-  (시행시기) ‘21.7.1. 이후 신탁을 설정하는 분부터 적용

-  ‘21.7.1. → ‘22.1.1.

ㅇ 수익자 등에 대한 제2차 납세의무 부과 

ㅇ (좌 동)

-  (시행시기) ‘21.7.1. 이후 납세의무가 성립하는 분부터 적용

-  ‘21.7.1. → ‘22.1.1.

ㅇ 수탁자가 납세의무자인 경우 
신탁재산별로 납세의무 부과

ㅇ (좌 동)

* 신탁재산에 대한 부가가치세 체납시 해당 신탁재산에 대해서만 강제징수, 신탁재산별 사업자등록

-  (시행시기) ‘21.7.1. 이후 재화 또는 용역을 공급하는 분부터 적용

-  ‘21.7.1. → ‘22.1.1.

ㅇ 납세의무자인 수탁자가 둘 이상인 경우 수탁자가 연대납세의무

* 신탁사무를 주로 처리하는 수탁자로 세무서에 신고한 자가 신고‧납부

ㅇ (좌 동)

-  (시행시기) ‘21.7.1. 이후 재화 또는 용역을 공급하는 분부터 적용

-  ‘21.7.1. → ‘22.1.1.

정  부  안

수  정  안

□ 수정수입세금계산서 발급 사유 확대

<현행 유지>

ㅇ 세관장이 결정ㆍ경정한 경우 또는 결정ㆍ경정할 것을 미리 알고 수입자가 수정신고하는 경우

6. 개별소비세법

정 부 안

수 정 안

□ 과세대상 담배 범위 확대

ㅇ「담배사업법」상 담배^* 및 
이와 유사한 것^**

* 연초의 ‘잎’이 원료인 경우로 한정

** 연초의 뿌리‧줄기 등이 원료인 경우 포함

<좌  동>

□ 액상형 전자담배 개별소비세율 조정

ㅇ 니코틴 용액 1㎖당 370원 → 740원

ㅇ 현행 세율(370원/㎖) 유지 

7. 주세법 및 주류 면허 등에 관한 법률

현    행(정부안 없음)

수  정  안

□ 주류면허 제한 사유

□ 주류 관련 법률 위반으로 한정

ㅇ 모든 법률을 위반하여 금고 이상의 실형 선고 후 5년이 경과하지 않거나, 금고 이상의 형의 집행 유예를 선고 받고 유예기간 중인 경우

ㅇ 모든 법률 → 「조세범 처벌법」, 
「전통주 등의 산업진흥에 관한 법률」, 「식품위생법」,「수입식품안전관리 특별법」, 「국민건강증진법」 §31의2제1호, 「청소년 보호법」 §56, §58 3호ㆍ6호, §59 1호ㆍ2호ㆍ6호ㆍ7호ㆍ7호의2ㆍ7호의3

8. 국제조세조정에 관한 법률

정  부  안

수  정  안

□ 해외금융계좌 신고대상에 

 해외 가상자산 추가

ㅇ (신고^*대상) 국외소재 가상자산사업자를 통한 가상자산 거래를 위해 개설한 계좌^*

* 매월말 계좌 잔액 5억원 초과시 
다음 연도 6월에 세무서장에 신고

ㅇ (시행시기) ’21.10.1. 이후 신고의무 발생분부터 적용

□ 시행시기 3개월 유예

ㅇ (좌 동)

ㅇ  `21.10.1. → `22.1.1.

9. 국세징수법

현 행(정부안 없음)

수  정  안

□ 의미를 직관적으로 알기 어려운 표현

ㅇ 체납처분

□ 의미를 명확히 드러내는 표현으로 수정

⇒ 강제징수

10. 관세사법

현     행(정부안 없음)

수  정  안

□ 명의대여 금지 관련 처벌대상

□ 처벌대상 추가

ㅇ 관세사 자격증·등록증 등을
대여한 자 및 대여받은 자

ㅇ (좌 동)

<추 가>

ㅇ 관세사 자격증·등록증 등을
대여 알선한 자

□ 벌칙 : 1년 이하 징역 또는 

 1천만 원 이하 과태료

□ (좌 동)

정 부 안

수  정  안

□ 유사명칭 사용 등에 대한 제재

□ 통관업 오인 광고에 대한 

벌칙 수준 상향

11. 관세법

현     행(정부안 없음)

수  정  안

□ 용어의 정의

□ 용어정의 추가

ㅇ 수입 ∼ 운영인

ㅇ (좌 동)

<추 가>

ㅇ (탁송품) 국제무역선·기 등을 
이용한 물품의 송달을 업으로 하는 자(휴대 반출입업자 제외)에게 위탁하여 반출입하는 물품

현     행(정부안 없음)

수  정  안

□ 보세판매장 특허수수료

◦ 기업회계기준상 매출액을 기준으로 산정

* 매장별 매출액을  기준으로 특허수수료율을 적용하여 계산

□ 감경근거 신설

◦ (좌  동)

<추 가>

-  단,「재난 및 안전관리 기본법」에 따른 재난으로 인해 영업 상 현저한 손실 발생 시 감경 가능

현  행(정부안 없음)

수  정  안

□ 통관보류 사유

□ 통관보류 대상 확대

ㅇ 관세법상 의무위반, 국민보건 위해 우려 등

ㅇ (좌 동)

ㅇ 세관장에게 체납처분이 위탁된 국세 체납자의 수입물품

ㅇ 세관장에게 체납처분이 위탁된 국세·지방세 체납자의 수입물품

현  행(정부안 없음)

수  정  안

□ 보세구역 물품 반입·반출 관련
200만원 이하 과태료 부과 대상

□ 과태료 부과대상 추가

ㅇ 물품 반입·반출 미신고자

ㅇ (좌 동)

<추 가>

-  보세구역에 물품을 반입하지 않고 거짓으로 반입신고 한 자

정 부 안

수  정  안

□ 관세 가산세

ㅇ 유관세물품 : 다음 금액 합산

-  부족세액의 10%(무신고 20%, 부정행위 40%)

-  미납세액 × 연체기간 × 일 0.025%

-  미납세액 × 3%(가산금)

□ 가산세 부과 범위 조정

ㅇ 무관세물품 : 「누락 과세표준」 × 0.8%(무신고 1.6%, 부정행위 3.2%)

<삭 제>

정 부 안

수  정  안

□ 특수관계거래에 대한 부적정 

자료제출 행위

ㅇ 미제출

ㅇ 거짓제출

ㅇ 부실제출

□ 부적정 행위 범위 조정

ㅇ (좌 동)

ㅇ (좌 동)

<삭 제>

□ 부적정 자료제출에 대한 과태료

ㅇ 자료종류에 따라 1억원 이하 과태료

ㅇ 시정요구 불이행시 최대 2억원 이하 과태료 추가 부과

□ 추가 과태료 미부과

ㅇ (좌 동)

<삭 제>

□ 특수관계 거래가격에 대한 증명요구

ㅇ (요건) 동종·동질물품 가격 등과 10% 이상 차이 등

<삭 제>

12. 조세특례제한법

현  행

(정부안 없음)

수  정  안

<신 설>

□ 특정사회기반시설 집합투자기구 배당소득에 대한 
분리과세

ㅇ (대상) ^➊특정사회기반시설에 대한 ^➋의무투자비율을 충족하는 ^➌공모 집합투자기구

* ➊ 특정사회기반시설의 구체적 범위 등은 대통령령으로 규정
➋ 집합투자재산의 50% 이상으로서 대통령령으로 정하는 비율
➌ 집합투자기구 유형은 대통령령에서 규정

ㅇ (세제지원) 배당소득 분리과세(원천징수로 납세의무 종결)

* 원천징수세율: 9%

ㅇ (한도) 투자금액 2억 원

ㅇ (적용기한) ’22.12.31.

정  부  안

수  정  안

□ 조합 등 예탁금 과세특례

ㅇ (대상) 상호금융 조합원ㆍ준조합원

ㅇ (연령) 가입 당시 20세 이상

ㅇ (지원) 이자소득 비과세 및 
저율 분리과세

① ’07~’22년분 : 비과세

② ‘23년분 : 분리과세(세율: 5%)

③ ‘24년 이후분 : 분리과세(세율: 9%)

□ 연령요건 조정

ㅇ (좌 동)

ㅇ (연령) 20세 → 19세

ㅇ (좌 동)

현    행(정부안 없음)

수  정  안

□ 상가임대료 인하에 대한 세액공제

ㅇ (대상) 소상공인인 임차인에 대해 상가건물 임대료를 인하한 부동산임대사업자

ㅇ (공제액) 적용기간 내 임대료 인하액의
50%를 소득세‧법인세에서 공제

ㅇ (적용기간) ’20.1.1. ~ ’20.6.30.

□ 적용기한 연장

ㅇ ’20.1.1. ~ ’21.6.30.

정  부  안

수  정  안

□ 지방이전 기업에 대한 세액감면 한도 신설

□ 감면한도 신설 보류

ㅇ 감면내용 

-  소득세‧법인세 7년간 100%, 

3년간 50% 감면

※ 수도권內,지방광역시,중규모도시로

이전 시 5년간100% + 2년간 50%

ㅇ (좌 동)

ㅇ 감면한도 신설

-  투자누계액 50%

+상시근로자수×1,500만 원

(청년근로자·서비스업 2,000만 원)

ㅇ (삭 제)

ㅇ (적용기한) ’22.12.31.

ㅇ (좌 동)

정  부  안

수  정  안

□ 전자신고 세액공제 대상 확대 및 적용기한 신설

□ 전자신고 세액공제 적용기한 신설 보류

ㅇ 세액공제 대상에 양도소득세 추가

-  양도소득세: 건당 2만 원

ㅇ (좌 동)

ㅇ (적용기한) ’22.12.31.

ㅇ (삭 제)

현 행(정부안 없음)

수  정  안

□ 영세개인사업자의 체납액 징수특례^* 적용 요건

* 가산금 면제, 분납 허용(최대 5년)

ㅇ (폐업일) ‘19.12.31.

ㅇ (재기기간) ’20.1.1.~’22.12.31.

ㅇ (징수곤란 체납액 기준) ’19.7.25.

ㅇ (신청기간) ’20.1.1.~’23.12.31.

□ 적용기한 1년 연장

ㅇ (폐업일) ‘20.12.31.

ㅇ (재기기간) ’20.1.1.~’23.12.31.

ㅇ (징수곤란 체납액 기준) 

-  ‘19.12.31. 이전 폐업시:  ’19.7.25.

-  ‘20.1.1.~12.31. 중 폐업시: ’20.7.25.

ㅇ (신청기간) ’20.1.1.~’24.12.31.

정  부  안

수  정  안

□ 연안화물선용 경유에 대한 유류세 감면

ㅇ (대상) 환경규제 강화^*에 따라 중유에서 경유로 유종 전환한 선박

* ’21.1월부터 연료유 황 함유량 기준 강화

□ 유류세 감면 대상 확대

ㅇ (대상) 모든 연안화물 선박

ㅇ (내용) 경유 유류세 15% 감면

ㅇ (좌 동)

ㅇ (적용기간) ’21.1.1. ~ ’22.12.31.(2년)

ㅇ (좌 동)

현  행(정부안 없음)

수  정  안

□ 설비투자자산의 가속상각 특례

□ ’21년 취득분에 한시적 적용 

ㅇ (지원내용) 기준내용연수의 50% (중소ㆍ중견기업은 75%) 범위 내에서 신고한 내용연수 적용

ㅇ (대상자산)

① 중소‧중견기업: 사업용 고정자산

② 대기업: 신성장기술 사업화 시설ㆍ생산성향상시설 등 혁신성장 투자자산 

ㅇ (적용기한) ’20.6.30.

ㅇ (적용기간) ’21.1.1.~‘21.12.31

정  부  안

수  정  안

□ 대규모 조합법인은 
과세특례 적용대상에서 제외

ㅇ (대상) 농협, 수협, 신협 등 조합법인 

-  다만, 매출액 1,000억 원 또는 
자산총액 5,000억 원 초과 
법인은 적용 배제

□ 조합법인 과세특례 적용기한 연장

ㅇ (대상) 농협, 수협, 신협 등 조합법인

<단서 삭제>

ㅇ (적용세율) 
과세표준 20억 원 이하 : 9%
과세표준 20억 원 초과 : 12%

ㅇ (세무조정) 9개 항목^*에 한정

* 기부금, 접대비, 과다경비, 업무무관경비, 
업무용 승용차 관련 비용, 지급이자, 
대손금, 대손충당금, 퇴직급여충당금

ㅇ (적용기한) ’22.12.31.

정  부  안

수  정  안

□ 육상 등 종목의 운동경기부를 설치한 내국법인에 대해 
3년간 운영비용^* 10% 세액공제
(장애인 운동경기부 : 5년간 20%)

* 선수･감독･코치 등 인건비 + 대회참가비, 훈련장비구입비 등

ㅇ (대상) 육상･탁구･유도･사이클 등 40여 개 종목

ㅇ (사후관리) 설치 후 3년 내(장애인 운동경기부의 경우 5년) 
해체 등의 경우 지원액 추징

ㅇ (적용기한) ’21.12.31.

<삭 제>

정  부  안

수  정  안

□ 증시안정펀드에 투자하여 투자손실 발생시, 
투자금액에 대한 법인세 세액공제

ㅇ (요건) 금융회사가 투자한 펀드를 모두 환매한 결과, 
최종적으로 투자손실^*이 발생한 경우

* 투자손실 = 전체 펀드 환매가액 -  전체 펀드 투자금액 + 전체 펀드 배당소득

ㅇ (공제율) 투자금액의 5%(투자 손실금액의 25% 한도)

ㅇ (적용기한) ’21.12.31일까지 투자하여 ’23.12.31일까지 
펀드를 모두 환매하는 경우 적용

<삭 제>

정  부  안

수  정  안

□ 개인 유사법인의 초과 유보소득 배당 간주 

ㅇ (적용대상) 최대주주^* 및 특수관계자가 
80% 이상 지분을 보유한 법인^**(개인 유사법인)

* 특수관계자와 함께 최대지분을 보유한 주주

** 사업특성 등을 감안하여 제외 법인은 시행령에 규정

<삭 제>

ㅇ (과세방식) 초과 유보소득은 주주에게 배당한 것으로 간주하여 주주에게 배당소득세 과세

-  배당 간주금액

= 초과 유보소득(유보소득 – 적정 유보소득) × 지분비율 

ㅇ (적용기준) 

-  (유보소득) 각 사업연도 소득금액 + (과오납환급금 이자 등) -  (이월결손금ㆍ세금 등)

-  (적정 유보소득) Max{(유보소득 + 잉여금처분에 따른 배당 등) × 50%, 자본금 × 10%} 

ㅇ (간주배당 귀속시기) 각 사업연도의 결산확정일

ㅇ (간주배당 지급시기) 각 사업연도의 법인세 신고기한

ㅇ (간주배당 소득세 원천징수) 개인 유사법인은 간주배당 지급시기에 개인주주에 대해 원천징수 

ㅇ (중복과세 조정) 향후 배당 간주금액을 주주에게 실제 배당하는 경우 배당소득으로 보지 않음

정  부  안

수  정  안

□ 장기일반민간임대주택^*에 대한 장기보유특별공제 특례

* 건설임대주택 + 매입임대주택

□ 건설임대주택에 대한 적용기한 유지

ㅇ 요건

 (전용면적) 85㎡ 이하

 (임대기간) 8년 이상

 (인상률 상한) 전년 대비 5%

 (기준시가) 6억 원 이하
(비수도권 3억 원)

ㅇ 특례

-  양도차익에 대한 장기보유
특별공제율 50% 적용
(10년 이상 임대시 70%)

-  장기보유특별공제 특례는 임대사업자 등록 이후 실제 임대기간으로 한정

ㅇ (적용기한) 2년 단축하여
‘20.12.31까지 등록

ㅇ 매입임대주택 : ‘20.12.31까지 등록
건설임대주택 : ‘22.12.31까지 등록

현 행(정부안 없음)

수  정  안

<신 설>

□ 전자고지 신청^* 납세자에 대한 세액공제

* 전자송달 방법으로 납부고지서 송달을 신청

ㅇ (대상) 중간예납하는 소득세, 예정고지·예정부과하는 부가가치세, 과세표준과 세액을 정부가 결정하는 국세(수시부과하는 경우는 제외)

ㅇ (공제금액) 대통령령으로 정하는 금액